塑料培养皿常被用来制作琼脂板为微生物学研究。琼脂一种特殊成分的混合物，可能包括营养物质，血液，盐类,碳水化合物、染料、指示剂、氨基酸或抗生素，一旦琼脂冷却和凝固，盘子就准备好了。接种(“镀”)含有微生物的样品。病毒或噬菌体培养需要两阶段接种：在琼脂制备后，细菌在培养皿中生长，为病毒接种提供宿主。培养皿被倒置，以减少空气中粒子污染的风险，并防止任何物质的积聚。水冷凝否则会扰乱或破坏一种文化。
  虽然培养皿在微生物学研究中很普遍，但较小的培养皿往往被用于大规模的研究，在这些研究中，塑料培养皿中生长的细胞可能相对昂贵且劳动密集。
一种特殊类型的培养皿是复制生物检测和计数，通常也称为罗达克板或接触板。这些是培养皿，其中中等突出(上升的琼脂水平)的边缘，使其更容易在硬物上取样。盘子也被划分成正方形，使CFU的计数更容易。它们经常被用来监测某些区域(例如厨房)的清洁程度。