由于这些原因，通过PCR扩增整合的病毒基因组已成为儿童多年来诊断HIV感染的首选方法。然而，这种方法需要在新生儿中进行静脉穿刺以进行血液采样和制备淋巴细胞颗粒，这两者都难以进行，特别是在发展中的国家。

新生儿采血卡干血斑样品是淋巴细胞颗粒的一种有趣的替代品，新生儿采血卡用于新生儿疾病筛查最方便快捷。因为只需要几滴血液并且可以直接收集在新生儿采血卡滤纸上。滤纸的储存和运输很容易，因为它们可以保持在室温下，并且DNA在干燥样品中具有良好的稳定性。DBS已被用于通过PCR检测HIV-1基因组，具有良好的灵敏度和特性。